بتاريخه الذي يناهز 150 سنة، يكون مستشفى سان خوان دي ديوس، واحدا من مستشفيات الأطفال الأوروبية الأربعة الأكثر استقبالا للأطفال.

ويشمل هذا المستشفى في قسم الأطفال، عددا من الوحدات الرائدة، مثل أقسام القلب والأعصاب وجراحة الأعصاب وجراحة الأعضاء الاصطناعية وتخصصات الأورام وطب الأجنة والعيون. كما أنه يتمتع بتميز خاص في مجال جراحة الصرع وزرع النخاع الشوكي فضلا عن تخصصه في تشخيص ومعالجة الأمراض النادرة والبحث فيها.

كما يشمل المستشفى برنامجا للبحث المتخصص في الأطفال والشباب، يعتبر واحدا من بين الأربعة الأهم في أوروبا، والذي يعتمد على وحد تجارب سريرية رائدة. وتبرز مجالات البحث فيه على صعيد الأورام لدى الأطفال والبيولوجيا الجزيئية والأمراض النادرة والأمراض التي تتصل بالفترة الجنينية والأمراض المعدية.